Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A4

CFAP20, Cilia- and flagella-associated protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20Q9Y6A4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP20Q9Y6A4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP20Q9Y6A4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP20Q9Y6A4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms