Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AGTPBP1Q9UPW5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AGTPBP1Q9UPW5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AGTPBP1Q9UPW5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AGTPBP1Q9UPW5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AGTPBP1Q9UPW5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AGTPBP1Q9UPW5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AGTPBP1Q9UPW5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AGTPBP1Q9UPW5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AGTPBP1Q9UPW5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AGTPBP1Q9UPW5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AGTPBP1Q9UPW5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AGTPBP1Q9UPW5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AGTPBP1Q9UPW5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
AGTPBP1Q9UPW5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AGTPBP1Q9UPW5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AGTPBP1Q9UPW5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AGTPBP1Q9UPW5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
AGTPBP1Q9UPW5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AGTPBP1Q9UPW5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
AGTPBP1Q9UPW5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AGTPBP1Q9UPW5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AGTPBP1Q9UPW5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AGTPBP1Q9UPW5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AGTPBP1Q9UPW5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AGTPBP1Q9UPW5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AGTPBP1Q9UPW5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
AGTPBP1Q9UPW5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AGTPBP1Q9UPW5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AGTPBP1Q9UPW5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AGTPBP1Q9UPW5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AGTPBP1Q9UPW5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AGTPBP1Q9UPW5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AGTPBP1Q9UPW5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
AGTPBP1Q9UPW5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AGTPBP1Q9UPW5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
AGTPBP1Q9UPW5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
AGTPBP1Q9UPW5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
AGTPBP1Q9UPW5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AGTPBP1Q9UPW5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
AGTPBP1Q9UPW5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AGTPBP1Q9UPW5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AGTPBP1Q9UPW5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AGTPBP1Q9UPW5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AGTPBP1Q9UPW5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AGTPBP1Q9UPW5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AGTPBP1Q9UPW5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AGTPBP1Q9UPW5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AGTPBP1Q9UPW5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AGTPBP1Q9UPW5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
AGTPBP1Q9UPW5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AGTPBP1Q9UPW5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AGTPBP1Q9UPW5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AGTPBP1Q9UPW5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
AGTPBP1Q9UPW5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
AGTPBP1Q9UPW5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AGTPBP1Q9UPW5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
AGTPBP1Q9UPW5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AGTPBP1Q9UPW5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
AGTPBP1Q9UPW5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 865.2 ms