Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGAP1Q9UPQ3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
AGAP1Q9UPQ3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
AGAP1Q9UPQ3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
AGAP1Q9UPQ3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
AGAP1Q9UPQ3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
AGAP1Q9UPQ3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
AGAP1Q9UPQ3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGAP1Q9UPQ3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGAP1Q9UPQ3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGAP1Q9UPQ3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGAP1Q9UPQ3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
AGAP1Q9UPQ3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGAP1Q9UPQ3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGAP1Q9UPQ3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGAP1Q9UPQ3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGAP1Q9UPQ3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGAP1Q9UPQ3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGAP1Q9UPQ3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGAP1Q9UPQ3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
AGAP1Q9UPQ3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGAP1Q9UPQ3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGAP1Q9UPQ3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGAP1Q9UPQ3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
AGAP1Q9UPQ3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGAP1Q9UPQ3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGAP1Q9UPQ3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGAP1Q9UPQ3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGAP1Q9UPQ3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms