Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV9

DDX41, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX41Q9UJV9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
DDX41Q9UJV9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DDX41Q9UJV9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX41Q9UJV9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX41Q9UJV9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX41Q9UJV9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX41Q9UJV9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX41Q9UJV9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX41Q9UJV9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX41Q9UJV9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX41Q9UJV9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX41Q9UJV9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX41Q9UJV9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX41Q9UJV9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX41Q9UJV9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX41Q9UJV9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX41Q9UJV9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX41Q9UJV9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX41Q9UJV9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX41Q9UJV9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX41Q9UJV9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX41Q9UJV9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX41Q9UJV9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX41Q9UJV9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX41Q9UJV9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX41Q9UJV9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX41Q9UJV9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX41Q9UJV9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX41Q9UJV9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX41Q9UJV9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX41Q9UJV9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX41Q9UJV9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX41Q9UJV9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX41Q9UJV9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms