Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH22Q9UJ99 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH22Q9UJ99 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH22Q9UJ99 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH22Q9UJ99 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH22Q9UJ99 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH22Q9UJ99 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH22Q9UJ99 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH22Q9UJ99 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH22Q9UJ99 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH22Q9UJ99 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH22Q9UJ99 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH22Q9UJ99 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH22Q9UJ99 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH22Q9UJ99 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH22Q9UJ99 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH22Q9UJ99 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH22Q9UJ99 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH22Q9UJ99 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH22Q9UJ99 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH22Q9UJ99 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH22Q9UJ99 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH22Q9UJ99 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH22Q9UJ99 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH22Q9UJ99 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH22Q9UJ99 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH22Q9UJ99 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH22Q9UJ99 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDH22Q9UJ99 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms