Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
PHRF1Q9P1Y6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PHRF1Q9P1Y6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PHRF1Q9P1Y6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PHRF1Q9P1Y6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PHRF1Q9P1Y6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PHRF1Q9P1Y6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PHRF1Q9P1Y6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
PHRF1Q9P1Y6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
PHRF1Q9P1Y6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PHRF1Q9P1Y6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PHRF1Q9P1Y6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PHRF1Q9P1Y6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
PHRF1Q9P1Y6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PHRF1Q9P1Y6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PHRF1Q9P1Y6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PHRF1Q9P1Y6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PHRF1Q9P1Y6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
PHRF1Q9P1Y6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PHRF1Q9P1Y6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PHRF1Q9P1Y6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PHRF1Q9P1Y6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PHRF1Q9P1Y6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PHRF1Q9P1Y6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PHRF1Q9P1Y6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PHRF1Q9P1Y6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PHRF1Q9P1Y6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PHRF1Q9P1Y6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PHRF1Q9P1Y6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PHRF1Q9P1Y6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PHRF1Q9P1Y6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PHRF1Q9P1Y6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PHRF1Q9P1Y6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
PHRF1Q9P1Y6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PHRF1Q9P1Y6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PHRF1Q9P1Y6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PHRF1Q9P1Y6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PHRF1Q9P1Y6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PHRF1Q9P1Y6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PHRF1Q9P1Y6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PHRF1Q9P1Y6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PHRF1Q9P1Y6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PHRF1Q9P1Y6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PHRF1Q9P1Y6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PHRF1Q9P1Y6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PHRF1Q9P1Y6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PHRF1Q9P1Y6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PHRF1Q9P1Y6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PHRF1Q9P1Y6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PHRF1Q9P1Y6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PHRF1Q9P1Y6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PHRF1Q9P1Y6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PHRF1Q9P1Y6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PHRF1Q9P1Y6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PHRF1Q9P1Y6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PHRF1Q9P1Y6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
PHRF1Q9P1Y6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PHRF1Q9P1Y6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PHRF1Q9P1Y6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PHRF1Q9P1Y6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PHRF1Q9P1Y6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PHRF1Q9P1Y6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PHRF1Q9P1Y6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
PHRF1Q9P1Y6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PHRF1Q9P1Y6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 272.8 ms