Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCHIP1Q9P0W5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCHIP1Q9P0W5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms