Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
MIS18AQ9NYP9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
MIS18AQ9NYP9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
MIS18AQ9NYP9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
MIS18AQ9NYP9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
MIS18AQ9NYP9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
MIS18AQ9NYP9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
MIS18AQ9NYP9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
MIS18AQ9NYP9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
MIS18AQ9NYP9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
MIS18AQ9NYP9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
MIS18AQ9NYP9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.6
MIS18AQ9NYP9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
MIS18AQ9NYP9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
MIS18AQ9NYP9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
MIS18AQ9NYP9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
MIS18AQ9NYP9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
MIS18AQ9NYP9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
MIS18AQ9NYP9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
MIS18AQ9NYP9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
MIS18AQ9NYP9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
MIS18AQ9NYP9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
MIS18AQ9NYP9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
MIS18AQ9NYP9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
MIS18AQ9NYP9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
MIS18AQ9NYP9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
MIS18AQ9NYP9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
MIS18AQ9NYP9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
MIS18AQ9NYP9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
MIS18AQ9NYP9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
MIS18AQ9NYP9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
MIS18AQ9NYP9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
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