Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMPD4Q9NXE4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms