Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH9

SLTM, SAFB-like transcription modulator, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLTMQ9NWH9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.621e-6■■■■□ 25.4
SLTMQ9NWH9 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.221e-6■■■■□ 25.4
SLTMQ9NWH9 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.541e-6■■■■□ 25.4
SLTMQ9NWH9 FXN-204ENST00000484259 359 ntTSL 33.8□□□□□ -1.81e-6■■■■□ 25.4
SLTMQ9NWH9 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.174e-6■■■■□ 25.4
SLTMQ9NWH9 C5orf66-203ENST00000513931 474 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.744e-6■■■■□ 25.4
SLTMQ9NWH9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.19■■■□□ 2.424e-6■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.254e-6■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 CHTF8-209ENST00000522497 831 ntTSL 224.88■■□□□ 1.574e-6■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 RAB31-205ENST00000578734 783 ntTSL 324.59■■□□□ 1.534e-6■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 RAB31-210ENST00000581109 469 ntTSL 324.59■■□□□ 1.534e-6■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 CHTF8-211ENST00000567763 734 ntTSL 224.46■■□□□ 1.514e-6■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.444e-6■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.424e-6■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.314e-6■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.154e-6■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 AP5Z1-207ENST00000496303 5660 ntTSL 219.56■□□□□ 0.724e-6■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.644e-6■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 AHRR-210ENST00000514523 563 ntTSL 418.42■□□□□ 0.544e-6■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 PIP4K2B-202ENST00000617499 547 ntTSL 417.56■□□□□ 0.44e-6■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.384e-6■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 AHRR-206ENST00000510400 576 ntTSL 416.74■□□□□ 0.274e-6■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.084e-6■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 04e-6■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 AP5Z1-204ENST00000477680 3081 ntTSL 214.73□□□□□ -0.054e-6■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 AC025171.1-201ENST00000314957 2388 ntTSL 1 (best)14.36□□□□□ -0.114e-6■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.124e-6■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.184e-6■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC13.57□□□□□ -0.244e-6■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 PIP4K2B-203ENST00000617781 927 ntTSL 212.78□□□□□ -0.364e-6■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 AL365181.2-201ENST00000606343 3222 ntBASIC12.33□□□□□ -0.444e-6■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.454e-6■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 RAB31-212ENST00000583921 583 ntTSL 49.34□□□□□ -0.914e-6■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 RAB31-201ENST00000435762 518 ntTSL 39.13□□□□□ -0.954e-6■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.754e-6■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 RAB31-203ENST00000577371 272 ntTSL 34□□□□□ -1.774e-6■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 RAB31-204ENST00000577796 295 ntTSL 33.31□□□□□ -1.884e-6■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.014e-7■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.774e-7■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.764e-7■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.454e-7■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.434e-7■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.154e-7■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.054e-7■■■■□ 25.3
SLTMQ9NWH9 AC025171.1-203ENST00000503152 608 ntTSL 27.89□□□□□ -1.153e-6■■■■□ 25.2
SLTMQ9NWH9 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.063e-6■■■■□ 25.2
SLTMQ9NWH9 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.374e-11■■■■□ 25.2
SLTMQ9NWH9 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.32e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.252e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.531e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.411e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.179e-8■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.111e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 SLC35E1-203ENST00000436553 1343 ntTSL 321.97■■□□□ 1.111e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 CCDC92-207ENST00000545037 559 ntTSL 221.77■■□□□ 1.081e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.051e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 CD58-204ENST00000464088 874 ntTSL 1 (best)21.6■■□□□ 1.051e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.041e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.041e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.041e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.991e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.831e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 ARL6IP4-213ENST00000536073 562 ntTSL 219.98■□□□□ 0.791e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.761e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 SREBF1-206ENST00000423161 1058 ntTSL 319.1■□□□□ 0.651e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.651e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 URGCP-213ENST00000497914 4360 ntTSL 1 (best)18.74■□□□□ 0.591e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.561e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 LRSAM1-208ENST00000486587 827 ntTSL 318.49■□□□□ 0.551e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.529e-8■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 SREBF1-211ENST00000476994 591 ntTSL 218.27■□□□□ 0.521e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 SLC35E1-210ENST00000600356 869 ntTSL 1 (best)18.16■□□□□ 0.51e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.491e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 LRSAM1-207ENST00000485704 413 ntTSL 517.96■□□□□ 0.471e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 TRIB3-203ENST00000449710 1070 ntTSL 517.94■□□□□ 0.469e-8■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 ARL6IP4-212ENST00000456762 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.74■□□□□ 0.431e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.48e-8■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.388e-8■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 IQSEC1-202ENST00000473088 545 ntTSL 417.42■□□□□ 0.381e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.388e-8■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.361e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.351e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.358e-8■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.348e-8■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.348e-8■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.31e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.188e-8■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 SMARCA4-219ENST00000592604 2940 ntTSL 1 (best)16.1■□□□□ 0.171e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 ERGIC1-209ENST00000520642 539 ntTSL 416.03■□□□□ 0.161e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.151e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 CCDC92-203ENST00000539551 860 ntTSL 315.85■□□□□ 0.131e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.121e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.118e-8■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 PMM2-211ENST00000566540 1557 ntTSL 1 (best)15.75■□□□□ 0.111e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 NUTM2A-AS1-210ENST00000451940 662 ntTSL 515.7■□□□□ 0.11e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 SREBF1-222ENST00000583732 580 ntTSL 415.61■□□□□ 0.091e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.071e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.071e-6■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.048e-8■■■■□ 25.1
SLTMQ9NWH9 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.041e-6■■■■□ 25.1
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