Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A11Q9NSA0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC22A11Q9NSA0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms