Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.36e-9■■□□□ 14.1
APOBEC3CQ9NRW3 EIF1-205ENST00000482111 1428 ntTSL 26.3□□□□□ -1.46e-9■■□□□ 14.1
APOBEC3CQ9NRW3 PSMB3-211ENST00000619426 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.356e-7■■□□□ 14.1
APOBEC3CQ9NRW3 PSMB3-208ENST00000613870 662 ntTSL 38.8□□□□□ -16e-7■■□□□ 14.1
APOBEC3CQ9NRW3 PSMB3-212ENST00000620309 552 ntTSL 27.61□□□□□ -1.196e-7■■□□□ 14.1
APOBEC3CQ9NRW3 PSMB3-207ENST00000610434 510 ntTSL 312.11□□□□□ -0.479e-7■■□□□ 14.1
APOBEC3CQ9NRW3 MRPL2-209ENST00000491898 1020 ntTSL 215.88■□□□□ 0.132e-6■■□□□ 14.1
APOBEC3CQ9NRW3 MRPL2-204ENST00000470667 765 ntTSL 512.63□□□□□ -0.392e-6■■□□□ 14.1
APOBEC3CQ9NRW3 HBE1-201ENST00000292896 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.743e-29■■□□□ 14.1
APOBEC3CQ9NRW3 HBE1-202ENST00000380237 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.83e-29■■□□□ 14.1
APOBEC3CQ9NRW3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.912e-8■■□□□ 14.1
APOBEC3CQ9NRW3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.852e-8■■□□□ 14.1
APOBEC3CQ9NRW3 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.232e-8■■□□□ 14.1
APOBEC3CQ9NRW3 APRT-203ENST00000562464 515 ntTSL 321.02■□□□□ 0.962e-8■■□□□ 14
APOBEC3CQ9NRW3 APRT-211ENST00000569616 788 ntTSL 518.37■□□□□ 0.532e-8■■□□□ 14
APOBEC3CQ9NRW3 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.282e-8■■□□□ 14
APOBEC3CQ9NRW3 APRT-207ENST00000567391 667 ntTSL 315.68■□□□□ 0.12e-8■■□□□ 14
APOBEC3CQ9NRW3 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.12e-8■■□□□ 14
APOBEC3CQ9NRW3 APRT-209ENST00000568319 542 ntTSL 314.1□□□□□ -0.152e-8■■□□□ 14
APOBEC3CQ9NRW3 APRT-202ENST00000426324 664 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.262e-8■■□□□ 14
APOBEC3CQ9NRW3 APRT-208ENST00000567713 470 ntTSL 512.64□□□□□ -0.392e-8■■□□□ 14
APOBEC3CQ9NRW3 HBE1-203ENST00000396895 578 ntTSL 55.82□□□□□ -1.486e-35■■□□□ 14
APOBEC3CQ9NRW3 APRT-210ENST00000568575 490 ntTSL 214.1□□□□□ -0.152e-11■■□□□ 14
APOBEC3CQ9NRW3 APRT-206ENST00000567057 437 ntTSL 212.58□□□□□ -0.42e-11■■□□□ 14
APOBEC3CQ9NRW3 RPL35-203ENST00000487431 785 ntTSL 1 (best)23.69■■□□□ 1.385e-20■■□□□ 14
APOBEC3CQ9NRW3 RPL35-205ENST00000495728 649 ntTSL 217.59■□□□□ 0.415e-20■■□□□ 14
APOBEC3CQ9NRW3 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.125e-20■■□□□ 14
APOBEC3CQ9NRW3 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.125e-20■■□□□ 14
APOBEC3CQ9NRW3 RPL35-204ENST00000493018 692 ntTSL 314.28□□□□□ -0.125e-20■■□□□ 14
APOBEC3CQ9NRW3 RPL35-202ENST00000373570 493 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.785e-20■■□□□ 14
APOBEC3CQ9NRW3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.091e-8■■□□□ 14
APOBEC3CQ9NRW3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.881e-8■■□□□ 14
APOBEC3CQ9NRW3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.811e-8■■□□□ 14
APOBEC3CQ9NRW3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.71e-8■■□□□ 14
APOBEC3CQ9NRW3 AL136531.2-201ENST00000618770 1164 ntTSL 220.1■□□□□ 0.811e-8■■□□□ 14
APOBEC3CQ9NRW3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.381e-8■■□□□ 14
APOBEC3CQ9NRW3 FKBP1A-209ENST00000612074 409 ntTSL 213.63□□□□□ -0.231e-8■■□□□ 14
APOBEC3CQ9NRW3 FKBP1A-207ENST00000474657 641 ntTSL 213.39□□□□□ -0.271e-8■■□□□ 14
APOBEC3CQ9NRW3 FKBP1A-201ENST00000381715 705 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.271e-8■■□□□ 14
APOBEC3CQ9NRW3 FKBP1A-202ENST00000381719 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.621e-8■■□□□ 14
APOBEC3CQ9NRW3 FKBP1A-203ENST00000381724 976 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.041e-8■■□□□ 14
APOBEC3CQ9NRW3 FKBP1A-208ENST00000474726 551 ntTSL 36.79□□□□□ -1.321e-8■■□□□ 14
APOBEC3CQ9NRW3 MYL4-210ENST00000576874 641 ntTSL 310.81□□□□□ -0.682e-7■■□□□ 14
APOBEC3CQ9NRW3 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.122e-6■■□□□ 14
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5G1-208ENST00000513781 759 ntTSL 316.12■□□□□ 0.171e-7■■□□□ 13.9
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5G1-210ENST00000515060 433 ntTSL 314.5□□□□□ -0.091e-7■■□□□ 13.9
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5G1-204ENST00000503641 539 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.411e-7■■□□□ 13.9
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5G1-206ENST00000506855 468 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.541e-7■■□□□ 13.9
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5G1-201ENST00000355938 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.611e-7■■□□□ 13.9
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5G1-202ENST00000393366 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.641e-7■■□□□ 13.9
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5G1-203ENST00000502964 679 ntTSL 210.78□□□□□ -0.681e-7■■□□□ 13.9
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5G1-207ENST00000513347 2214 ntTSL 28.92□□□□□ -0.981e-7■■□□□ 13.9
APOBEC3CQ9NRW3 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.042e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 AC046185.1-201ENST00000580553 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.522e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.482e-10■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.112e-10■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.643e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-231ENST00000591097 1507 ntTSL 1 (best)25.26■■□□□ 1.633e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-205ENST00000585913 833 ntTSL 323.76■■□□□ 1.393e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.353e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-224ENST00000589686 532 ntTSL 222.98■■□□□ 1.273e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-208ENST00000586548 1734 ntTSL 322.74■■□□□ 1.233e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-229ENST00000590704 1456 ntTSL 222.64■■□□□ 1.213e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-226ENST00000590171 905 ntTSL 322.55■■□□□ 1.23e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-234ENST00000591659 587 ntTSL 222.55■■□□□ 1.23e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.23e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.193e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.193e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.053e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.033e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.933e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.933e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-238ENST00000592412 532 ntTSL 420.31■□□□□ 0.843e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.833e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.833e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-232ENST00000591376 830 ntTSL 320.25■□□□□ 0.833e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-237ENST00000592234 571 ntTSL 520.25■□□□□ 0.833e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-210ENST00000586636 938 ntTSL 220.25■□□□□ 0.833e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-243ENST00000593128 796 ntTSL 319.77■□□□□ 0.763e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.743e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-244ENST00000593283 758 ntTSL 519.4■□□□□ 0.73e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.653e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-206ENST00000585914 1052 ntTSL 518.7■□□□□ 0.583e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.493e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-241ENST00000593048 650 ntTSL 317.79■□□□□ 0.443e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-230ENST00000591055 928 ntTSL 217.44■□□□□ 0.383e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-212ENST00000587169 3028 ntTSL 215.78■□□□□ 0.123e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-228ENST00000590347 3117 ntTSL 213.54□□□□□ -0.243e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-242ENST00000593093 3528 ntTSL 212.95□□□□□ -0.343e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 UBR4-203ENST00000375225 1533 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.466e-16■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 UBR4-208ENST00000459947 3873 ntTSL 211.65□□□□□ -0.546e-16■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CORO1C-201ENST00000261401 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.623e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 AL137127.1-201ENST00000606379 3402 ntBASIC10.3□□□□□ -0.766e-16■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CIRBP-218ENST00000588344 370 ntTSL 39.78□□□□□ -0.843e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 UBR4-202ENST00000375224 3475 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.096e-16■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 CORO1C-202ENST00000420959 3921 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.163e-7■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 UBR4-214ENST00000486515 536 ntTSL 37.4□□□□□ -1.226e-16■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.446e-16■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.768e-15■■□□□ 13.8
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.018e-15■■□□□ 13.8
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