Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ94

A1CF, APOBEC1 complementation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1CFQ9NQ94 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
A1CFQ9NQ94 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
A1CFQ9NQ94 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
A1CFQ9NQ94 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
A1CFQ9NQ94 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A1CFQ9NQ94 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A1CFQ9NQ94 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A1CFQ9NQ94 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A1CFQ9NQ94 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A1CFQ9NQ94 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A1CFQ9NQ94 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
A1CFQ9NQ94 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
A1CFQ9NQ94 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
A1CFQ9NQ94 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
A1CFQ9NQ94 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
A1CFQ9NQ94 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A1CFQ9NQ94 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
A1CFQ9NQ94 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
A1CFQ9NQ94 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
A1CFQ9NQ94 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
A1CFQ9NQ94 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
A1CFQ9NQ94 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
A1CFQ9NQ94 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
A1CFQ9NQ94 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
A1CFQ9NQ94 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
A1CFQ9NQ94 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
A1CFQ9NQ94 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
A1CFQ9NQ94 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A1CFQ9NQ94 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A1CFQ9NQ94 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
A1CFQ9NQ94 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A1CFQ9NQ94 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
A1CFQ9NQ94 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A1CFQ9NQ94 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
A1CFQ9NQ94 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A1CFQ9NQ94 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A1CFQ9NQ94 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
A1CFQ9NQ94 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A1CFQ9NQ94 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A1CFQ9NQ94 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
A1CFQ9NQ94 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
A1CFQ9NQ94 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A1CFQ9NQ94 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A1CFQ9NQ94 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A1CFQ9NQ94 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A1CFQ9NQ94 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
A1CFQ9NQ94 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A1CFQ9NQ94 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A1CFQ9NQ94 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
A1CFQ9NQ94 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
A1CFQ9NQ94 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
A1CFQ9NQ94 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
A1CFQ9NQ94 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
A1CFQ9NQ94 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
A1CFQ9NQ94 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A1CFQ9NQ94 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A1CFQ9NQ94 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A1CFQ9NQ94 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A1CFQ9NQ94 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
A1CFQ9NQ94 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A1CFQ9NQ94 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A1CFQ9NQ94 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A1CFQ9NQ94 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A1CFQ9NQ94 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
A1CFQ9NQ94 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A1CFQ9NQ94 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A1CFQ9NQ94 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
A1CFQ9NQ94 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A1CFQ9NQ94 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A1CFQ9NQ94 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms