Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP4F12Q9HCS2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP4F12Q9HCS2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP4F12Q9HCS2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP4F12Q9HCS2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP4F12Q9HCS2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP4F12Q9HCS2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP4F12Q9HCS2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP4F12Q9HCS2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP4F12Q9HCS2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP4F12Q9HCS2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP4F12Q9HCS2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP4F12Q9HCS2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP4F12Q9HCS2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP4F12Q9HCS2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP4F12Q9HCS2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP4F12Q9HCS2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP4F12Q9HCS2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CYP4F12Q9HCS2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP4F12Q9HCS2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms