Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA4CQ9C0C4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA4CQ9C0C4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA4CQ9C0C4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA4CQ9C0C4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA4CQ9C0C4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA4CQ9C0C4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA4CQ9C0C4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA4CQ9C0C4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4CQ9C0C4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4CQ9C0C4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4CQ9C0C4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4CQ9C0C4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4CQ9C0C4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4CQ9C0C4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA4CQ9C0C4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA4CQ9C0C4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4CQ9C0C4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4CQ9C0C4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4CQ9C0C4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4CQ9C0C4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4CQ9C0C4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4CQ9C0C4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4CQ9C0C4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA4CQ9C0C4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA4CQ9C0C4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA4CQ9C0C4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA4CQ9C0C4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4CQ9C0C4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4CQ9C0C4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4CQ9C0C4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4CQ9C0C4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4CQ9C0C4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4CQ9C0C4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4CQ9C0C4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA4CQ9C0C4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4CQ9C0C4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4CQ9C0C4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4CQ9C0C4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4CQ9C0C4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4CQ9C0C4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA4CQ9C0C4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4CQ9C0C4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4CQ9C0C4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4CQ9C0C4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4CQ9C0C4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4CQ9C0C4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA4CQ9C0C4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEMA4CQ9C0C4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms