Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SEMA4CQ9C0C4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SEMA4CQ9C0C4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SEMA4CQ9C0C4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SEMA4CQ9C0C4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SEMA4CQ9C0C4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SEMA4CQ9C0C4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
SEMA4CQ9C0C4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SEMA4CQ9C0C4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SEMA4CQ9C0C4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SEMA4CQ9C0C4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SEMA4CQ9C0C4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SEMA4CQ9C0C4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SEMA4CQ9C0C4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SEMA4CQ9C0C4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SEMA4CQ9C0C4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SEMA4CQ9C0C4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SEMA4CQ9C0C4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SEMA4CQ9C0C4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SEMA4CQ9C0C4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SEMA4CQ9C0C4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SEMA4CQ9C0C4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SEMA4CQ9C0C4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SEMA4CQ9C0C4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SEMA4CQ9C0C4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SEMA4CQ9C0C4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SEMA4CQ9C0C4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SEMA4CQ9C0C4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SEMA4CQ9C0C4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SEMA4CQ9C0C4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SEMA4CQ9C0C4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SEMA4CQ9C0C4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SEMA4CQ9C0C4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SEMA4CQ9C0C4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SEMA4CQ9C0C4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SEMA4CQ9C0C4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SEMA4CQ9C0C4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEMA4CQ9C0C4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SEMA4CQ9C0C4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SEMA4CQ9C0C4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SEMA4CQ9C0C4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEMA4CQ9C0C4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEMA4CQ9C0C4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEMA4CQ9C0C4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEMA4CQ9C0C4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SEMA4CQ9C0C4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEMA4CQ9C0C4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEMA4CQ9C0C4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEMA4CQ9C0C4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEMA4CQ9C0C4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEMA4CQ9C0C4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEMA4CQ9C0C4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEMA4CQ9C0C4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEMA4CQ9C0C4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEMA4CQ9C0C4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEMA4CQ9C0C4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEMA4CQ9C0C4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEMA4CQ9C0C4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SEMA4CQ9C0C4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEMA4CQ9C0C4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEMA4CQ9C0C4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEMA4CQ9C0C4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEMA4CQ9C0C4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEMA4CQ9C0C4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEMA4CQ9C0C4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEMA4CQ9C0C4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SEMA4CQ9C0C4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEMA4CQ9C0C4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEMA4CQ9C0C4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEMA4CQ9C0C4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEMA4CQ9C0C4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEMA4CQ9C0C4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEMA4CQ9C0C4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEMA4CQ9C0C4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEMA4CQ9C0C4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEMA4CQ9C0C4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEMA4CQ9C0C4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEMA4CQ9C0C4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEMA4CQ9C0C4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEMA4CQ9C0C4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SEMA4CQ9C0C4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA4CQ9C0C4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA4CQ9C0C4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEMA4CQ9C0C4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEMA4CQ9C0C4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA4CQ9C0C4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA4CQ9C0C4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA4CQ9C0C4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEMA4CQ9C0C4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA4CQ9C0C4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEMA4CQ9C0C4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SEMA4CQ9C0C4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEMA4CQ9C0C4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA4CQ9C0C4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMA4CQ9C0C4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEMA4CQ9C0C4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEMA4CQ9C0C4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEMA4CQ9C0C4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms