Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
HIRIP3Q9BW71 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
HIRIP3Q9BW71 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
HIRIP3Q9BW71 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
HIRIP3Q9BW71 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
HIRIP3Q9BW71 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
HIRIP3Q9BW71 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
HIRIP3Q9BW71 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
HIRIP3Q9BW71 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
HIRIP3Q9BW71 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
HIRIP3Q9BW71 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
HIRIP3Q9BW71 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
HIRIP3Q9BW71 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
HIRIP3Q9BW71 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
HIRIP3Q9BW71 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
HIRIP3Q9BW71 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
HIRIP3Q9BW71 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
HIRIP3Q9BW71 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
HIRIP3Q9BW71 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
HIRIP3Q9BW71 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
HIRIP3Q9BW71 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
HIRIP3Q9BW71 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
HIRIP3Q9BW71 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
HIRIP3Q9BW71 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
HIRIP3Q9BW71 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
HIRIP3Q9BW71 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
HIRIP3Q9BW71 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
HIRIP3Q9BW71 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
HIRIP3Q9BW71 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
HIRIP3Q9BW71 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
HIRIP3Q9BW71 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
HIRIP3Q9BW71 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
HIRIP3Q9BW71 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
HIRIP3Q9BW71 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
HIRIP3Q9BW71 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
HIRIP3Q9BW71 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
HIRIP3Q9BW71 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
HIRIP3Q9BW71 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
HIRIP3Q9BW71 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
HIRIP3Q9BW71 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
HIRIP3Q9BW71 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
HIRIP3Q9BW71 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
HIRIP3Q9BW71 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
HIRIP3Q9BW71 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
HIRIP3Q9BW71 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
HIRIP3Q9BW71 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
HIRIP3Q9BW71 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
HIRIP3Q9BW71 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
HIRIP3Q9BW71 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
HIRIP3Q9BW71 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
HIRIP3Q9BW71 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
HIRIP3Q9BW71 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
HIRIP3Q9BW71 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
HIRIP3Q9BW71 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
HIRIP3Q9BW71 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
HIRIP3Q9BW71 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC34.39■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
HIRIP3Q9BW71 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
HIRIP3Q9BW71 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
HIRIP3Q9BW71 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
HIRIP3Q9BW71 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
HIRIP3Q9BW71 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
HIRIP3Q9BW71 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
HIRIP3Q9BW71 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms