Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NUDCD1Q96RS6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NUDCD1Q96RS6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDCD1Q96RS6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms