Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UIMC1Q96RL1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UIMC1Q96RL1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UIMC1Q96RL1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UIMC1Q96RL1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UIMC1Q96RL1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UIMC1Q96RL1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UIMC1Q96RL1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UIMC1Q96RL1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UIMC1Q96RL1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UIMC1Q96RL1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UIMC1Q96RL1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UIMC1Q96RL1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UIMC1Q96RL1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UIMC1Q96RL1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UIMC1Q96RL1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UIMC1Q96RL1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UIMC1Q96RL1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UIMC1Q96RL1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
UIMC1Q96RL1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UIMC1Q96RL1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UIMC1Q96RL1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UIMC1Q96RL1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UIMC1Q96RL1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UIMC1Q96RL1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
UIMC1Q96RL1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UIMC1Q96RL1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
UIMC1Q96RL1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UIMC1Q96RL1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UIMC1Q96RL1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
UIMC1Q96RL1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UIMC1Q96RL1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.3 ms