Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP4Q96P64 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP4Q96P64 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP4Q96P64 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP4Q96P64 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP4Q96P64 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP4Q96P64 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP4Q96P64 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP4Q96P64 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP4Q96P64 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP4Q96P64 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP4Q96P64 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP4Q96P64 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP4Q96P64 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP4Q96P64 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP4Q96P64 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP4Q96P64 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP4Q96P64 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP4Q96P64 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms