Protein–RNA interactions for Protein: Q96NI6

LRFN5, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN5Q96NI6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN5Q96NI6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN5Q96NI6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms