Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SHISA4Q96DD7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHISA4Q96DD7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHISA4Q96DD7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SHISA4Q96DD7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHISA4Q96DD7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHISA4Q96DD7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHISA4Q96DD7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHISA4Q96DD7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHISA4Q96DD7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHISA4Q96DD7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHISA4Q96DD7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SHISA4Q96DD7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHISA4Q96DD7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHISA4Q96DD7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHISA4Q96DD7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHISA4Q96DD7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHISA4Q96DD7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SHISA4Q96DD7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SHISA4Q96DD7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHISA4Q96DD7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHISA4Q96DD7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHISA4Q96DD7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHISA4Q96DD7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHISA4Q96DD7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHISA4Q96DD7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SHISA4Q96DD7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SHISA4Q96DD7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SHISA4Q96DD7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SHISA4Q96DD7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SHISA4Q96DD7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SHISA4Q96DD7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHISA4Q96DD7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SHISA4Q96DD7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SHISA4Q96DD7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SHISA4Q96DD7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SHISA4Q96DD7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHISA4Q96DD7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SHISA4Q96DD7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SHISA4Q96DD7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SHISA4Q96DD7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SHISA4Q96DD7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SHISA4Q96DD7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SHISA4Q96DD7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHISA4Q96DD7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHISA4Q96DD7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHISA4Q96DD7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHISA4Q96DD7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHISA4Q96DD7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHISA4Q96DD7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHISA4Q96DD7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHISA4Q96DD7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHISA4Q96DD7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHISA4Q96DD7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHISA4Q96DD7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHISA4Q96DD7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SHISA4Q96DD7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHISA4Q96DD7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SHISA4Q96DD7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SHISA4Q96DD7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SHISA4Q96DD7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SHISA4Q96DD7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SHISA4Q96DD7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms