Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRIM52Q96A61 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRIM52Q96A61 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRIM52Q96A61 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRIM52Q96A61 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRIM52Q96A61 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRIM52Q96A61 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRIM52Q96A61 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TRIM52Q96A61 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TRIM52Q96A61 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TRIM52Q96A61 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TRIM52Q96A61 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRIM52Q96A61 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRIM52Q96A61 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRIM52Q96A61 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRIM52Q96A61 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRIM52Q96A61 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRIM52Q96A61 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRIM52Q96A61 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRIM52Q96A61 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
TRIM52Q96A61 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRIM52Q96A61 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRIM52Q96A61 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRIM52Q96A61 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRIM52Q96A61 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRIM52Q96A61 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRIM52Q96A61 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
TRIM52Q96A61 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TRIM52Q96A61 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TRIM52Q96A61 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TRIM52Q96A61 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TRIM52Q96A61 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
TRIM52Q96A61 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TRIM52Q96A61 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM52Q96A61 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM52Q96A61 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM52Q96A61 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM52Q96A61 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM52Q96A61 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM52Q96A61 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM52Q96A61 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM52Q96A61 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM52Q96A61 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRIM52Q96A61 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRIM52Q96A61 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRIM52Q96A61 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRIM52Q96A61 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRIM52Q96A61 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRIM52Q96A61 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRIM52Q96A61 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TRIM52Q96A61 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
TRIM52Q96A61 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
TRIM52Q96A61 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TRIM52Q96A61 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TRIM52Q96A61 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TRIM52Q96A61 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
TRIM52Q96A61 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
TRIM52Q96A61 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TRIM52Q96A61 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRIM52Q96A61 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TRIM52Q96A61 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TRIM52Q96A61 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TRIM52Q96A61 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TRIM52Q96A61 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TRIM52Q96A61 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRIM52Q96A61 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRIM52Q96A61 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRIM52Q96A61 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRIM52Q96A61 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
TRIM52Q96A61 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRIM52Q96A61 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRIM52Q96A61 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRIM52Q96A61 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRIM52Q96A61 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRIM52Q96A61 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRIM52Q96A61 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TRIM52Q96A61 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TRIM52Q96A61 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
TRIM52Q96A61 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
TRIM52Q96A61 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TRIM52Q96A61 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TRIM52Q96A61 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TRIM52Q96A61 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
TRIM52Q96A61 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRIM52Q96A61 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms