Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF4BQ92750 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF4BQ92750 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF4BQ92750 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF4BQ92750 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF4BQ92750 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TAF4BQ92750 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TAF4BQ92750 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TAF4BQ92750 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TAF4BQ92750 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TAF4BQ92750 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TAF4BQ92750 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TAF4BQ92750 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TAF4BQ92750 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TAF4BQ92750 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TAF4BQ92750 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TAF4BQ92750 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TAF4BQ92750 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TAF4BQ92750 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TAF4BQ92750 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TAF4BQ92750 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TAF4BQ92750 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TAF4BQ92750 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TAF4BQ92750 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TAF4BQ92750 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF4BQ92750 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF4BQ92750 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 986.9 ms