Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
CTTNBP2Q8WZ74 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
CTTNBP2Q8WZ74 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CTTNBP2Q8WZ74 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CTTNBP2Q8WZ74 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CTTNBP2Q8WZ74 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CTTNBP2Q8WZ74 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CTTNBP2Q8WZ74 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
CTTNBP2Q8WZ74 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
CTTNBP2Q8WZ74 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CTTNBP2Q8WZ74 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CTTNBP2Q8WZ74 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
CTTNBP2Q8WZ74 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
CTTNBP2Q8WZ74 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
CTTNBP2Q8WZ74 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
CTTNBP2Q8WZ74 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
CTTNBP2Q8WZ74 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC39.13■■■■□ 3.86
CTTNBP2Q8WZ74 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.86
CTTNBP2Q8WZ74 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
CTTNBP2Q8WZ74 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CTTNBP2Q8WZ74 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CTTNBP2Q8WZ74 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
CTTNBP2Q8WZ74 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CTTNBP2Q8WZ74 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CTTNBP2Q8WZ74 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
CTTNBP2Q8WZ74 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
CTTNBP2Q8WZ74 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
CTTNBP2Q8WZ74 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
CTTNBP2Q8WZ74 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
CTTNBP2Q8WZ74 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
CTTNBP2Q8WZ74 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
CTTNBP2Q8WZ74 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
CTTNBP2Q8WZ74 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
CTTNBP2Q8WZ74 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CTTNBP2Q8WZ74 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
CTTNBP2Q8WZ74 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
CTTNBP2Q8WZ74 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
CTTNBP2Q8WZ74 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
CTTNBP2Q8WZ74 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
CTTNBP2Q8WZ74 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
CTTNBP2Q8WZ74 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
CTTNBP2Q8WZ74 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
CTTNBP2Q8WZ74 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
CTTNBP2Q8WZ74 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CTTNBP2Q8WZ74 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CTTNBP2Q8WZ74 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CTTNBP2Q8WZ74 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CTTNBP2Q8WZ74 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CTTNBP2Q8WZ74 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CTTNBP2Q8WZ74 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CTTNBP2Q8WZ74 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CTTNBP2Q8WZ74 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CTTNBP2Q8WZ74 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CTTNBP2Q8WZ74 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CTTNBP2Q8WZ74 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CTTNBP2Q8WZ74 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC39.01■■■■□ 3.84
CTTNBP2Q8WZ74 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CTTNBP2Q8WZ74 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CTTNBP2Q8WZ74 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
CTTNBP2Q8WZ74 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CTTNBP2Q8WZ74 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CTTNBP2Q8WZ74 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CTTNBP2Q8WZ74 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CTTNBP2Q8WZ74 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CTTNBP2Q8WZ74 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC38.98■■■■□ 3.83
CTTNBP2Q8WZ74 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CTTNBP2Q8WZ74 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CTTNBP2Q8WZ74 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CTTNBP2Q8WZ74 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CTTNBP2Q8WZ74 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CTTNBP2Q8WZ74 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CTTNBP2Q8WZ74 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
CTTNBP2Q8WZ74 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
CTTNBP2Q8WZ74 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
CTTNBP2Q8WZ74 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CTTNBP2Q8WZ74 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CTTNBP2Q8WZ74 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CTTNBP2Q8WZ74 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CTTNBP2Q8WZ74 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC38.93■■■■□ 3.82
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CTTNBP2Q8WZ74 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC38.93■■■■□ 3.82
CTTNBP2Q8WZ74 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC38.93■■■■□ 3.82
CTTNBP2Q8WZ74 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CTTNBP2Q8WZ74 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC38.93■■■■□ 3.82
CTTNBP2Q8WZ74 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CTTNBP2Q8WZ74 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
CTTNBP2Q8WZ74 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CTTNBP2Q8WZ74 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CTTNBP2Q8WZ74 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CTTNBP2Q8WZ74 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CTTNBP2Q8WZ74 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
CTTNBP2Q8WZ74 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CTTNBP2Q8WZ74 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms