Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC56.28■■■■■ 6.6
CTTNBP2Q8WZ74 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC55.59■■■■■ 6.49
CTTNBP2Q8WZ74 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.89■■■■■ 6.38
CTTNBP2Q8WZ74 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC54.84■■■■■ 6.37
CTTNBP2Q8WZ74 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.52■■■■■ 6.32
CTTNBP2Q8WZ74 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.28■■■■■ 6.28
CTTNBP2Q8WZ74 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.14■■■■■ 6.26
CTTNBP2Q8WZ74 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC53.89■■■■■ 6.22
CTTNBP2Q8WZ74 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.21■■■■■ 6.11
CTTNBP2Q8WZ74 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC53.15■■■■■ 6.1
CTTNBP2Q8WZ74 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC53.09■■■■■ 6.09
CTTNBP2Q8WZ74 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC53.04■■■■■ 6.08
CTTNBP2Q8WZ74 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.77■■■■■ 6.04
CTTNBP2Q8WZ74 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC52.75■■■■■ 6.04
CTTNBP2Q8WZ74 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC52.75■■■■■ 6.04
CTTNBP2Q8WZ74 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC52.52■■■■■ 6
CTTNBP2Q8WZ74 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.35■■■■■ 5.97
CTTNBP2Q8WZ74 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC52.27■■■■■ 5.96
CTTNBP2Q8WZ74 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.2■■■■■ 5.95
CTTNBP2Q8WZ74 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.95■■■■■ 5.91
CTTNBP2Q8WZ74 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.73■■■■■ 5.87
CTTNBP2Q8WZ74 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC51.7■■■■■ 5.87
CTTNBP2Q8WZ74 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.66■■■■■ 5.86
CTTNBP2Q8WZ74 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.61■■■■■ 5.85
CTTNBP2Q8WZ74 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC51.61■■■■■ 5.85
CTTNBP2Q8WZ74 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC51.44■■■■■ 5.82
CTTNBP2Q8WZ74 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.43■■■■■ 5.82
CTTNBP2Q8WZ74 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC51.31■■■■■ 5.8
CTTNBP2Q8WZ74 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.11■■■■■ 5.77
CTTNBP2Q8WZ74 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.04■■■■■ 5.76
CTTNBP2Q8WZ74 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC50.99■■■■■ 5.75
CTTNBP2Q8WZ74 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.97■■■■■ 5.75
CTTNBP2Q8WZ74 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC50.69■■■■■ 5.7
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.62■■■■■ 5.69
CTTNBP2Q8WZ74 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC50.6■■■■■ 5.69
CTTNBP2Q8WZ74 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC50.48■■■■■ 5.67
CTTNBP2Q8WZ74 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC50.44■■■■■ 5.66
CTTNBP2Q8WZ74 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC50.35■■■■■ 5.65
CTTNBP2Q8WZ74 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC50.29■■■■■ 5.64
CTTNBP2Q8WZ74 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC50.13■■■■■ 5.61
CTTNBP2Q8WZ74 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.98■■■■■ 5.59
CTTNBP2Q8WZ74 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.83■■■■■ 5.57
CTTNBP2Q8WZ74 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC49.82■■■■■ 5.57
CTTNBP2Q8WZ74 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.79■■■■■ 5.56
CTTNBP2Q8WZ74 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.76■■■■■ 5.56
CTTNBP2Q8WZ74 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC49.75■■■■■ 5.55
CTTNBP2Q8WZ74 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.75■■■■■ 5.55
CTTNBP2Q8WZ74 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC49.55■■■■■ 5.52
CTTNBP2Q8WZ74 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC49.52■■■■■ 5.52
CTTNBP2Q8WZ74 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC49.49■■■■■ 5.51
CTTNBP2Q8WZ74 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.32■■■■■ 5.49
CTTNBP2Q8WZ74 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC49.1■■■■■ 5.45
CTTNBP2Q8WZ74 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC49.06■■■■■ 5.44
CTTNBP2Q8WZ74 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC49.04■■■■■ 5.44
CTTNBP2Q8WZ74 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.03■■■■■ 5.44
CTTNBP2Q8WZ74 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC48.96■■■■■ 5.43
CTTNBP2Q8WZ74 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.91■■■■■ 5.42
CTTNBP2Q8WZ74 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.82■■■■■ 5.41
CTTNBP2Q8WZ74 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.82■■■■■ 5.41
CTTNBP2Q8WZ74 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC48.82■■■■■ 5.41
CTTNBP2Q8WZ74 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.8■■■■■ 5.4
CTTNBP2Q8WZ74 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC48.78■■■■■ 5.4
CTTNBP2Q8WZ74 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC48.72■■■■■ 5.39
CTTNBP2Q8WZ74 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC48.69■■■■■ 5.39
CTTNBP2Q8WZ74 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.69■■■■■ 5.38
CTTNBP2Q8WZ74 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.62■■■■■ 5.37
CTTNBP2Q8WZ74 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.6■■■■■ 5.37
CTTNBP2Q8WZ74 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC48.6■■■■■ 5.37
CTTNBP2Q8WZ74 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC48.59■■■■■ 5.37
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC48.59■■■■■ 5.37
CTTNBP2Q8WZ74 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC48.59■■■■■ 5.37
CTTNBP2Q8WZ74 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.52■■■■■ 5.36
CTTNBP2Q8WZ74 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.48■■■■■ 5.35
CTTNBP2Q8WZ74 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.48■■■■■ 5.35
CTTNBP2Q8WZ74 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.48■■■■■ 5.35
CTTNBP2Q8WZ74 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.43■■■■■ 5.34
CTTNBP2Q8WZ74 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC48.37■■■■■ 5.33
CTTNBP2Q8WZ74 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC48.37■■■■■ 5.33
CTTNBP2Q8WZ74 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.36■■■■■ 5.33
CTTNBP2Q8WZ74 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC48.36■■■■■ 5.33
CTTNBP2Q8WZ74 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC48.32■■■■■ 5.33
CTTNBP2Q8WZ74 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC48.28■■■■■ 5.32
CTTNBP2Q8WZ74 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.24■■■■■ 5.31
CTTNBP2Q8WZ74 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.24■■■■■ 5.31
CTTNBP2Q8WZ74 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
CTTNBP2Q8WZ74 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.23■■■■■ 5.31
CTTNBP2Q8WZ74 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
CTTNBP2Q8WZ74 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.17■■■■■ 5.3
CTTNBP2Q8WZ74 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC48.17■■■■■ 5.3
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC48.17■■■■■ 5.3
CTTNBP2Q8WZ74 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC48.16■■■■■ 5.3
CTTNBP2Q8WZ74 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
CTTNBP2Q8WZ74 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC48.07■■■■■ 5.29
CTTNBP2Q8WZ74 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.05■■■■■ 5.28
CTTNBP2Q8WZ74 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.99■■■■■ 5.27
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC47.86■■■■■ 5.25
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC47.86■■■■■ 5.25
CTTNBP2Q8WZ74 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.83■■■■■ 5.25
CTTNBP2Q8WZ74 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC47.83■■■■■ 5.25
CTTNBP2Q8WZ74 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC47.8■■■■■ 5.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms