Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDAC7Q8WUI4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC7Q8WUI4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC7Q8WUI4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC7Q8WUI4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC7Q8WUI4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDAC7Q8WUI4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC7Q8WUI4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC7Q8WUI4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC7Q8WUI4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC7Q8WUI4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC7Q8WUI4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC7Q8WUI4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC7Q8WUI4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDAC7Q8WUI4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC7Q8WUI4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC7Q8WUI4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC7Q8WUI4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC7Q8WUI4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC7Q8WUI4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC7Q8WUI4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC7Q8WUI4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDAC7Q8WUI4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HDAC7Q8WUI4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC7Q8WUI4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC7Q8WUI4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 224.1 ms