Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEC5

SH3RF2, Putative E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF2, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF2Q8TEC5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3RF2Q8TEC5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3RF2Q8TEC5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3RF2Q8TEC5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3RF2Q8TEC5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3RF2Q8TEC5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3RF2Q8TEC5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3RF2Q8TEC5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3RF2Q8TEC5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SH3RF2Q8TEC5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3RF2Q8TEC5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SH3RF2Q8TEC5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3RF2Q8TEC5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3RF2Q8TEC5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3RF2Q8TEC5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3RF2Q8TEC5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3RF2Q8TEC5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3RF2Q8TEC5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3RF2Q8TEC5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3RF2Q8TEC5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3RF2Q8TEC5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3RF2Q8TEC5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3RF2Q8TEC5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3RF2Q8TEC5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3RF2Q8TEC5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3RF2Q8TEC5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3RF2Q8TEC5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3RF2Q8TEC5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3RF2Q8TEC5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3RF2Q8TEC5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3RF2Q8TEC5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3RF2Q8TEC5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3RF2Q8TEC5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms