Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAU0

NKX2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-3Q8TAU0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NKX2-3Q8TAU0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NKX2-3Q8TAU0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NKX2-3Q8TAU0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NKX2-3Q8TAU0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NKX2-3Q8TAU0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NKX2-3Q8TAU0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NKX2-3Q8TAU0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NKX2-3Q8TAU0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NKX2-3Q8TAU0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NKX2-3Q8TAU0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NKX2-3Q8TAU0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NKX2-3Q8TAU0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NKX2-3Q8TAU0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NKX2-3Q8TAU0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NKX2-3Q8TAU0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NKX2-3Q8TAU0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NKX2-3Q8TAU0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NKX2-3Q8TAU0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NKX2-3Q8TAU0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NKX2-3Q8TAU0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NKX2-3Q8TAU0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NKX2-3Q8TAU0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.2 ms