Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HELBQ8NG08 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HELBQ8NG08 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HELBQ8NG08 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HELBQ8NG08 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HELBQ8NG08 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
HELBQ8NG08 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HELBQ8NG08 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HELBQ8NG08 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HELBQ8NG08 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HELBQ8NG08 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
HELBQ8NG08 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HELBQ8NG08 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HELBQ8NG08 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HELBQ8NG08 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HELBQ8NG08 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HELBQ8NG08 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HELBQ8NG08 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HELBQ8NG08 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HELBQ8NG08 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HELBQ8NG08 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HELBQ8NG08 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HELBQ8NG08 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HELBQ8NG08 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HELBQ8NG08 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HELBQ8NG08 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HELBQ8NG08 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HELBQ8NG08 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HELBQ8NG08 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HELBQ8NG08 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HELBQ8NG08 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HELBQ8NG08 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HELBQ8NG08 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HELBQ8NG08 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HELBQ8NG08 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HELBQ8NG08 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HELBQ8NG08 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HELBQ8NG08 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HELBQ8NG08 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HELBQ8NG08 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HELBQ8NG08 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HELBQ8NG08 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HELBQ8NG08 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HELBQ8NG08 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HELBQ8NG08 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HELBQ8NG08 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HELBQ8NG08 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HELBQ8NG08 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HELBQ8NG08 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
HELBQ8NG08 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HELBQ8NG08 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HELBQ8NG08 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HELBQ8NG08 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HELBQ8NG08 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HELBQ8NG08 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HELBQ8NG08 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HELBQ8NG08 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HELBQ8NG08 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HELBQ8NG08 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HELBQ8NG08 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HELBQ8NG08 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HELBQ8NG08 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HELBQ8NG08 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HELBQ8NG08 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HELBQ8NG08 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HELBQ8NG08 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HELBQ8NG08 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HELBQ8NG08 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HELBQ8NG08 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HELBQ8NG08 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HELBQ8NG08 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HELBQ8NG08 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HELBQ8NG08 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HELBQ8NG08 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HELBQ8NG08 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
HELBQ8NG08 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HELBQ8NG08 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HELBQ8NG08 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HELBQ8NG08 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HELBQ8NG08 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HELBQ8NG08 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HELBQ8NG08 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HELBQ8NG08 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
HELBQ8NG08 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HELBQ8NG08 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HELBQ8NG08 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HELBQ8NG08 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HELBQ8NG08 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HELBQ8NG08 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HELBQ8NG08 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HELBQ8NG08 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HELBQ8NG08 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HELBQ8NG08 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HELBQ8NG08 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HELBQ8NG08 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HELBQ8NG08 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HELBQ8NG08 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HELBQ8NG08 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
HELBQ8NG08 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HELBQ8NG08 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms