Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC42.66■■■■■ 4.42
HELBQ8NG08 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC41.54■■■■■ 4.24
HELBQ8NG08 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
HELBQ8NG08 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
HELBQ8NG08 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
HELBQ8NG08 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
HELBQ8NG08 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
HELBQ8NG08 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.9■■■■■ 4.14
HELBQ8NG08 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
HELBQ8NG08 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
HELBQ8NG08 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
HELBQ8NG08 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
HELBQ8NG08 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
HELBQ8NG08 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC39.71■■■■□ 3.95
HELBQ8NG08 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
HELBQ8NG08 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
HELBQ8NG08 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
HELBQ8NG08 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
HELBQ8NG08 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
HELBQ8NG08 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
HELBQ8NG08 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
HELBQ8NG08 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
HELBQ8NG08 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
HELBQ8NG08 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
HELBQ8NG08 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
HELBQ8NG08 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
HELBQ8NG08 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
HELBQ8NG08 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
HELBQ8NG08 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
HELBQ8NG08 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
HELBQ8NG08 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
HELBQ8NG08 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
HELBQ8NG08 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
HELBQ8NG08 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
HELBQ8NG08 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
HELBQ8NG08 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
HELBQ8NG08 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
HELBQ8NG08 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
HELBQ8NG08 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
HELBQ8NG08 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
HELBQ8NG08 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
HELBQ8NG08 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
HELBQ8NG08 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
HELBQ8NG08 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
HELBQ8NG08 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
HELBQ8NG08 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
HELBQ8NG08 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
HELBQ8NG08 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
HELBQ8NG08 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
HELBQ8NG08 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
HELBQ8NG08 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
HELBQ8NG08 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
HELBQ8NG08 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
HELBQ8NG08 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
HELBQ8NG08 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
HELBQ8NG08 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
HELBQ8NG08 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
HELBQ8NG08 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
HELBQ8NG08 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
HELBQ8NG08 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
HELBQ8NG08 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
HELBQ8NG08 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
HELBQ8NG08 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
HELBQ8NG08 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
HELBQ8NG08 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
HELBQ8NG08 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
HELBQ8NG08 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
HELBQ8NG08 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
HELBQ8NG08 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
HELBQ8NG08 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
HELBQ8NG08 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
HELBQ8NG08 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
HELBQ8NG08 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
HELBQ8NG08 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
HELBQ8NG08 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
HELBQ8NG08 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
HELBQ8NG08 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
HELBQ8NG08 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
HELBQ8NG08 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
HELBQ8NG08 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
HELBQ8NG08 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
HELBQ8NG08 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
HELBQ8NG08 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
HELBQ8NG08 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
HELBQ8NG08 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
HELBQ8NG08 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
HELBQ8NG08 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
HELBQ8NG08 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
HELBQ8NG08 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
HELBQ8NG08 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
HELBQ8NG08 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
HELBQ8NG08 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
HELBQ8NG08 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
HELBQ8NG08 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
HELBQ8NG08 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
HELBQ8NG08 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
HELBQ8NG08 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
HELBQ8NG08 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
HELBQ8NG08 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
HELBQ8NG08 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms