Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FSIP1Q8NA03 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.2 ms