Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z3

SPICE1, Spindle and centriole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPICE1Q8N0Z3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPICE1Q8N0Z3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPICE1Q8N0Z3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPICE1Q8N0Z3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPICE1Q8N0Z3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPICE1Q8N0Z3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPICE1Q8N0Z3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPICE1Q8N0Z3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPICE1Q8N0Z3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPICE1Q8N0Z3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPICE1Q8N0Z3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPICE1Q8N0Z3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPICE1Q8N0Z3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPICE1Q8N0Z3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPICE1Q8N0Z3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPICE1Q8N0Z3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPICE1Q8N0Z3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPICE1Q8N0Z3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPICE1Q8N0Z3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPICE1Q8N0Z3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPICE1Q8N0Z3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPICE1Q8N0Z3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPICE1Q8N0Z3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPICE1Q8N0Z3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPICE1Q8N0Z3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPICE1Q8N0Z3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPICE1Q8N0Z3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPICE1Q8N0Z3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SPICE1Q8N0Z3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPICE1Q8N0Z3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPICE1Q8N0Z3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPICE1Q8N0Z3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPICE1Q8N0Z3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPICE1Q8N0Z3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPICE1Q8N0Z3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPICE1Q8N0Z3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPICE1Q8N0Z3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPICE1Q8N0Z3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPICE1Q8N0Z3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPICE1Q8N0Z3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPICE1Q8N0Z3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPICE1Q8N0Z3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPICE1Q8N0Z3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPICE1Q8N0Z3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPICE1Q8N0Z3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPICE1Q8N0Z3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPICE1Q8N0Z3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPICE1Q8N0Z3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPICE1Q8N0Z3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPICE1Q8N0Z3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SPICE1Q8N0Z3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPICE1Q8N0Z3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPICE1Q8N0Z3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPICE1Q8N0Z3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SPICE1Q8N0Z3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPICE1Q8N0Z3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SPICE1Q8N0Z3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPICE1Q8N0Z3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPICE1Q8N0Z3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPICE1Q8N0Z3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPICE1Q8N0Z3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPICE1Q8N0Z3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SPICE1Q8N0Z3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SPICE1Q8N0Z3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPICE1Q8N0Z3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPICE1Q8N0Z3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPICE1Q8N0Z3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPICE1Q8N0Z3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPICE1Q8N0Z3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPICE1Q8N0Z3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPICE1Q8N0Z3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPICE1Q8N0Z3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPICE1Q8N0Z3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPICE1Q8N0Z3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPICE1Q8N0Z3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPICE1Q8N0Z3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPICE1Q8N0Z3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SPICE1Q8N0Z3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPICE1Q8N0Z3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPICE1Q8N0Z3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms