Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED13LQ71F56 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED13LQ71F56 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED13LQ71F56 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED13LQ71F56 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MED13LQ71F56 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED13LQ71F56 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED13LQ71F56 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED13LQ71F56 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED13LQ71F56 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED13LQ71F56 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED13LQ71F56 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED13LQ71F56 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED13LQ71F56 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms