Protein–RNA interactions for Protein: Q719H9

KCTD1, BTB/POZ domain-containing protein KCTD1, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD1Q719H9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCTD1Q719H9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCTD1Q719H9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCTD1Q719H9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCTD1Q719H9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCTD1Q719H9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCTD1Q719H9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCTD1Q719H9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCTD1Q719H9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCTD1Q719H9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCTD1Q719H9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCTD1Q719H9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCTD1Q719H9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCTD1Q719H9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCTD1Q719H9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCTD1Q719H9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCTD1Q719H9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCTD1Q719H9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCTD1Q719H9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCTD1Q719H9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCTD1Q719H9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCTD1Q719H9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms