Protein–RNA interactions for Protein: Q719H9

KCTD1, BTB/POZ domain-containing protein KCTD1, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD1Q719H9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.13■■■■■ 4.01
KCTD1Q719H9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
KCTD1Q719H9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
KCTD1Q719H9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
KCTD1Q719H9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
KCTD1Q719H9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
KCTD1Q719H9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
KCTD1Q719H9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
KCTD1Q719H9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
KCTD1Q719H9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
KCTD1Q719H9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
KCTD1Q719H9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
KCTD1Q719H9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
KCTD1Q719H9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
KCTD1Q719H9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
KCTD1Q719H9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
KCTD1Q719H9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
KCTD1Q719H9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
KCTD1Q719H9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
KCTD1Q719H9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
KCTD1Q719H9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
KCTD1Q719H9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
KCTD1Q719H9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
KCTD1Q719H9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
KCTD1Q719H9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
KCTD1Q719H9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
KCTD1Q719H9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
KCTD1Q719H9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
KCTD1Q719H9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
KCTD1Q719H9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
KCTD1Q719H9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
KCTD1Q719H9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
KCTD1Q719H9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
KCTD1Q719H9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
KCTD1Q719H9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
KCTD1Q719H9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
KCTD1Q719H9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
KCTD1Q719H9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
KCTD1Q719H9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
KCTD1Q719H9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
KCTD1Q719H9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
KCTD1Q719H9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
KCTD1Q719H9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
KCTD1Q719H9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
KCTD1Q719H9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
KCTD1Q719H9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
KCTD1Q719H9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
KCTD1Q719H9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
KCTD1Q719H9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
KCTD1Q719H9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
KCTD1Q719H9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
KCTD1Q719H9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
KCTD1Q719H9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
KCTD1Q719H9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
KCTD1Q719H9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
KCTD1Q719H9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
KCTD1Q719H9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
KCTD1Q719H9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
KCTD1Q719H9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
KCTD1Q719H9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
KCTD1Q719H9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
KCTD1Q719H9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
KCTD1Q719H9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
KCTD1Q719H9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
KCTD1Q719H9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
KCTD1Q719H9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
KCTD1Q719H9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KCTD1Q719H9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KCTD1Q719H9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KCTD1Q719H9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KCTD1Q719H9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KCTD1Q719H9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KCTD1Q719H9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
KCTD1Q719H9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
KCTD1Q719H9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
KCTD1Q719H9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KCTD1Q719H9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KCTD1Q719H9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KCTD1Q719H9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KCTD1Q719H9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KCTD1Q719H9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KCTD1Q719H9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KCTD1Q719H9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KCTD1Q719H9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KCTD1Q719H9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
KCTD1Q719H9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KCTD1Q719H9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KCTD1Q719H9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KCTD1Q719H9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KCTD1Q719H9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
KCTD1Q719H9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KCTD1Q719H9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KCTD1Q719H9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KCTD1Q719H9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KCTD1Q719H9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
KCTD1Q719H9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KCTD1Q719H9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KCTD1Q719H9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
KCTD1Q719H9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KCTD1Q719H9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms