Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP17L2Q6R6M4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP17L2Q6R6M4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms