Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5X7

TMEM71, Transmembrane protein 71, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM71Q6P5X7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM71Q6P5X7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM71Q6P5X7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM71Q6P5X7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM71Q6P5X7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM71Q6P5X7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM71Q6P5X7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM71Q6P5X7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM71Q6P5X7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM71Q6P5X7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM71Q6P5X7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM71Q6P5X7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM71Q6P5X7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM71Q6P5X7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM71Q6P5X7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM71Q6P5X7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM71Q6P5X7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM71Q6P5X7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM71Q6P5X7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM71Q6P5X7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM71Q6P5X7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM71Q6P5X7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM71Q6P5X7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM71Q6P5X7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM71Q6P5X7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM71Q6P5X7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM71Q6P5X7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM71Q6P5X7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM71Q6P5X7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM71Q6P5X7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM71Q6P5X7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM71Q6P5X7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM71Q6P5X7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM71Q6P5X7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM71Q6P5X7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM71Q6P5X7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM71Q6P5X7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM71Q6P5X7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM71Q6P5X7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM71Q6P5X7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM71Q6P5X7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM71Q6P5X7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM71Q6P5X7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM71Q6P5X7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM71Q6P5X7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM71Q6P5X7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM71Q6P5X7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM71Q6P5X7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms