Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-BQ31612 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-BQ31612 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms