Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCB5Q2M3G0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCB5Q2M3G0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCB5Q2M3G0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCB5Q2M3G0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCB5Q2M3G0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCB5Q2M3G0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCB5Q2M3G0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCB5Q2M3G0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCB5Q2M3G0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCB5Q2M3G0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCB5Q2M3G0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCB5Q2M3G0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCB5Q2M3G0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCB5Q2M3G0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCB5Q2M3G0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCB5Q2M3G0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCB5Q2M3G0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCB5Q2M3G0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCB5Q2M3G0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCB5Q2M3G0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCB5Q2M3G0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCB5Q2M3G0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCB5Q2M3G0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCB5Q2M3G0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCB5Q2M3G0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCB5Q2M3G0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCB5Q2M3G0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCB5Q2M3G0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCB5Q2M3G0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCB5Q2M3G0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCB5Q2M3G0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCB5Q2M3G0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCB5Q2M3G0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCB5Q2M3G0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCB5Q2M3G0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCB5Q2M3G0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCB5Q2M3G0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCB5Q2M3G0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCB5Q2M3G0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCB5Q2M3G0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCB5Q2M3G0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCB5Q2M3G0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCB5Q2M3G0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCB5Q2M3G0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCB5Q2M3G0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCB5Q2M3G0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCB5Q2M3G0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCB5Q2M3G0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCB5Q2M3G0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCB5Q2M3G0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCB5Q2M3G0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCB5Q2M3G0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCB5Q2M3G0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCB5Q2M3G0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCB5Q2M3G0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCB5Q2M3G0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCB5Q2M3G0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCB5Q2M3G0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCB5Q2M3G0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCB5Q2M3G0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCB5Q2M3G0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCB5Q2M3G0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCB5Q2M3G0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCB5Q2M3G0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms