Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.72■■■■■ 4.11
ABCB5Q2M3G0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.78■■■■□ 3.96
ABCB5Q2M3G0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
ABCB5Q2M3G0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
ABCB5Q2M3G0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
ABCB5Q2M3G0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
ABCB5Q2M3G0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
ABCB5Q2M3G0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
ABCB5Q2M3G0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
ABCB5Q2M3G0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
ABCB5Q2M3G0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
ABCB5Q2M3G0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
ABCB5Q2M3G0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
ABCB5Q2M3G0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
ABCB5Q2M3G0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
ABCB5Q2M3G0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
ABCB5Q2M3G0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
ABCB5Q2M3G0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
ABCB5Q2M3G0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ABCB5Q2M3G0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
ABCB5Q2M3G0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
ABCB5Q2M3G0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ABCB5Q2M3G0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ABCB5Q2M3G0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ABCB5Q2M3G0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ABCB5Q2M3G0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ABCB5Q2M3G0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ABCB5Q2M3G0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ABCB5Q2M3G0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
ABCB5Q2M3G0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
ABCB5Q2M3G0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ABCB5Q2M3G0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ABCB5Q2M3G0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ABCB5Q2M3G0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCB5Q2M3G0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ABCB5Q2M3G0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ABCB5Q2M3G0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
ABCB5Q2M3G0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCB5Q2M3G0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ABCB5Q2M3G0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ABCB5Q2M3G0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCB5Q2M3G0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ABCB5Q2M3G0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
ABCB5Q2M3G0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ABCB5Q2M3G0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
ABCB5Q2M3G0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ABCB5Q2M3G0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ABCB5Q2M3G0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ABCB5Q2M3G0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ABCB5Q2M3G0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ABCB5Q2M3G0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ABCB5Q2M3G0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ABCB5Q2M3G0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ABCB5Q2M3G0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ABCB5Q2M3G0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ABCB5Q2M3G0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ABCB5Q2M3G0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ABCB5Q2M3G0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ABCB5Q2M3G0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ABCB5Q2M3G0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ABCB5Q2M3G0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ABCB5Q2M3G0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ABCB5Q2M3G0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCB5Q2M3G0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ABCB5Q2M3G0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
ABCB5Q2M3G0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.21
ABCB5Q2M3G0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ABCB5Q2M3G0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ABCB5Q2M3G0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ABCB5Q2M3G0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ABCB5Q2M3G0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ABCB5Q2M3G0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ABCB5Q2M3G0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ABCB5Q2M3G0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ABCB5Q2M3G0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ABCB5Q2M3G0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ABCB5Q2M3G0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ABCB5Q2M3G0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ABCB5Q2M3G0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ABCB5Q2M3G0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ABCB5Q2M3G0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ABCB5Q2M3G0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
ABCB5Q2M3G0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ABCB5Q2M3G0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ABCB5Q2M3G0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ABCB5Q2M3G0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ABCB5Q2M3G0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ABCB5Q2M3G0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
ABCB5Q2M3G0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ABCB5Q2M3G0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ABCB5Q2M3G0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ABCB5Q2M3G0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ABCB5Q2M3G0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ABCB5Q2M3G0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ABCB5Q2M3G0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ABCB5Q2M3G0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ABCB5Q2M3G0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ABCB5Q2M3G0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ABCB5Q2M3G0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ABCB5Q2M3G0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms