Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMPD4Q14CM0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMPD4Q14CM0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMPD4Q14CM0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMPD4Q14CM0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMPD4Q14CM0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMPD4Q14CM0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMPD4Q14CM0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMPD4Q14CM0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMPD4Q14CM0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMPD4Q14CM0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMPD4Q14CM0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMPD4Q14CM0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMPD4Q14CM0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FRMPD4Q14CM0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FRMPD4Q14CM0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FRMPD4Q14CM0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
FRMPD4Q14CM0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FRMPD4Q14CM0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FRMPD4Q14CM0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FRMPD4Q14CM0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FRMPD4Q14CM0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FRMPD4Q14CM0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FRMPD4Q14CM0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FRMPD4Q14CM0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMPD4Q14CM0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMPD4Q14CM0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMPD4Q14CM0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMPD4Q14CM0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMPD4Q14CM0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMPD4Q14CM0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMPD4Q14CM0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMPD4Q14CM0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMPD4Q14CM0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMPD4Q14CM0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMPD4Q14CM0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMPD4Q14CM0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMPD4Q14CM0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMPD4Q14CM0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMPD4Q14CM0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMPD4Q14CM0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMPD4Q14CM0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMPD4Q14CM0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMPD4Q14CM0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMPD4Q14CM0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMPD4Q14CM0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMPD4Q14CM0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMPD4Q14CM0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMPD4Q14CM0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMPD4Q14CM0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMPD4Q14CM0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMPD4Q14CM0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMPD4Q14CM0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMPD4Q14CM0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMPD4Q14CM0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMPD4Q14CM0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMPD4Q14CM0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMPD4Q14CM0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMPD4Q14CM0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMPD4Q14CM0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMPD4Q14CM0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMPD4Q14CM0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMPD4Q14CM0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMPD4Q14CM0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMPD4Q14CM0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMPD4Q14CM0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FRMPD4Q14CM0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FRMPD4Q14CM0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FRMPD4Q14CM0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMPD4Q14CM0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMPD4Q14CM0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMPD4Q14CM0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMPD4Q14CM0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMPD4Q14CM0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD4Q14CM0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD4Q14CM0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD4Q14CM0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD4Q14CM0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD4Q14CM0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD4Q14CM0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD4Q14CM0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD4Q14CM0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD4Q14CM0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD4Q14CM0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD4Q14CM0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMPD4Q14CM0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMPD4Q14CM0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMPD4Q14CM0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMPD4Q14CM0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMPD4Q14CM0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRMPD4Q14CM0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRMPD4Q14CM0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRMPD4Q14CM0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRMPD4Q14CM0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRMPD4Q14CM0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD4Q14CM0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD4Q14CM0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD4Q14CM0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD4Q14CM0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD4Q14CM0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
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