Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCINQ13939 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCINQ13939 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCINQ13939 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCINQ13939 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCINQ13939 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCINQ13939 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCINQ13939 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCINQ13939 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCINQ13939 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCINQ13939 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCINQ13939 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCINQ13939 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCINQ13939 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCINQ13939 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCINQ13939 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCINQ13939 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCINQ13939 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCINQ13939 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCINQ13939 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCINQ13939 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCINQ13939 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCINQ13939 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCINQ13939 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCINQ13939 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCINQ13939 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCINQ13939 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCINQ13939 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCINQ13939 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCINQ13939 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCINQ13939 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCINQ13939 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCINQ13939 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCINQ13939 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCINQ13939 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCINQ13939 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCINQ13939 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCINQ13939 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCINQ13939 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCINQ13939 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCINQ13939 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCINQ13939 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCINQ13939 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCINQ13939 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCINQ13939 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCINQ13939 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCINQ13939 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCINQ13939 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCINQ13939 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCINQ13939 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCINQ13939 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCINQ13939 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCINQ13939 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCINQ13939 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCINQ13939 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCINQ13939 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCINQ13939 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCINQ13939 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCINQ13939 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCINQ13939 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCINQ13939 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCINQ13939 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCINQ13939 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCINQ13939 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCINQ13939 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCINQ13939 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCINQ13939 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCINQ13939 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCINQ13939 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCINQ13939 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCINQ13939 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCINQ13939 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCINQ13939 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCINQ13939 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCINQ13939 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCINQ13939 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCINQ13939 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCINQ13939 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCINQ13939 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCINQ13939 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCINQ13939 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCINQ13939 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCINQ13939 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCINQ13939 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCINQ13939 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCINQ13939 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCINQ13939 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCINQ13939 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCINQ13939 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCINQ13939 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCINQ13939 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCINQ13939 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCINQ13939 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCINQ13939 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCINQ13939 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCINQ13939 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCINQ13939 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCINQ13939 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCINQ13939 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCINQ13939 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
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