Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FOXO1Q12778 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXO1Q12778 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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