Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1DQ01668 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1DQ01668 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1DQ01668 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms