Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
SCN7AQ01118 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SCN7AQ01118 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SCN7AQ01118 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
SCN7AQ01118 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SCN7AQ01118 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SCN7AQ01118 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
SCN7AQ01118 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SCN7AQ01118 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SCN7AQ01118 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SCN7AQ01118 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SCN7AQ01118 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
SCN7AQ01118 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SCN7AQ01118 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SCN7AQ01118 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCN7AQ01118 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCN7AQ01118 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCN7AQ01118 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCN7AQ01118 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCN7AQ01118 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCN7AQ01118 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
SCN7AQ01118 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCN7AQ01118 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCN7AQ01118 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCN7AQ01118 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCN7AQ01118 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCN7AQ01118 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCN7AQ01118 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCN7AQ01118 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCN7AQ01118 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCN7AQ01118 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCN7AQ01118 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCN7AQ01118 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SCN7AQ01118 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCN7AQ01118 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCN7AQ01118 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCN7AQ01118 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCN7AQ01118 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
SCN7AQ01118 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCN7AQ01118 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCN7AQ01118 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SCN7AQ01118 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SCN7AQ01118 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SCN7AQ01118 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SCN7AQ01118 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SCN7AQ01118 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SCN7AQ01118 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SCN7AQ01118 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SCN7AQ01118 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SCN7AQ01118 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SCN7AQ01118 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SCN7AQ01118 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SCN7AQ01118 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SCN7AQ01118 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SCN7AQ01118 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SCN7AQ01118 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SCN7AQ01118 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SCN7AQ01118 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SCN7AQ01118 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SCN7AQ01118 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SCN7AQ01118 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SCN7AQ01118 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SCN7AQ01118 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SCN7AQ01118 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SCN7AQ01118 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms