Protein–RNA interactions for Protein: P98177

FOXO4, Forkhead box protein O4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO4P98177 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
FOXO4P98177 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FOXO4P98177 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FOXO4P98177 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FOXO4P98177 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FOXO4P98177 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FOXO4P98177 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FOXO4P98177 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
FOXO4P98177 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOXO4P98177 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOXO4P98177 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOXO4P98177 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOXO4P98177 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOXO4P98177 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FOXO4P98177 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
FOXO4P98177 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
FOXO4P98177 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FOXO4P98177 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
FOXO4P98177 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FOXO4P98177 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FOXO4P98177 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FOXO4P98177 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FOXO4P98177 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
FOXO4P98177 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FOXO4P98177 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FOXO4P98177 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FOXO4P98177 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FOXO4P98177 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FOXO4P98177 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FOXO4P98177 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FOXO4P98177 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FOXO4P98177 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FOXO4P98177 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
FOXO4P98177 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
FOXO4P98177 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
FOXO4P98177 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FOXO4P98177 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FOXO4P98177 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FOXO4P98177 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FOXO4P98177 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FOXO4P98177 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FOXO4P98177 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FOXO4P98177 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FOXO4P98177 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FOXO4P98177 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FOXO4P98177 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FOXO4P98177 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FOXO4P98177 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FOXO4P98177 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FOXO4P98177 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FOXO4P98177 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FOXO4P98177 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FOXO4P98177 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FOXO4P98177 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FOXO4P98177 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FOXO4P98177 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FOXO4P98177 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FOXO4P98177 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FOXO4P98177 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FOXO4P98177 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FOXO4P98177 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FOXO4P98177 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FOXO4P98177 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FOXO4P98177 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.7 ms