Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARFIP2P53365 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFIP2P53365 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms