Protein–RNA interactions for Protein: P49757

NUMB, Protein numb homolog, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUMBP49757 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUMBP49757 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUMBP49757 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUMBP49757 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUMBP49757 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUMBP49757 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUMBP49757 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUMBP49757 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUMBP49757 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUMBP49757 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUMBP49757 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUMBP49757 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUMBP49757 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUMBP49757 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUMBP49757 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUMBP49757 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUMBP49757 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUMBP49757 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUMBP49757 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUMBP49757 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUMBP49757 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUMBP49757 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUMBP49757 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUMBP49757 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUMBP49757 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUMBP49757 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NUMBP49757 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUMBP49757 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUMBP49757 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUMBP49757 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUMBP49757 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUMBP49757 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUMBP49757 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUMBP49757 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NUMBP49757 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUMBP49757 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUMBP49757 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NUMBP49757 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUMBP49757 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUMBP49757 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUMBP49757 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUMBP49757 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUMBP49757 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUMBP49757 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUMBP49757 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUMBP49757 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NUMBP49757 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NUMBP49757 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUMBP49757 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUMBP49757 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUMBP49757 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUMBP49757 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUMBP49757 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUMBP49757 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUMBP49757 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUMBP49757 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUMBP49757 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUMBP49757 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUMBP49757 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUMBP49757 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUMBP49757 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUMBP49757 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NUMBP49757 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUMBP49757 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUMBP49757 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUMBP49757 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUMBP49757 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUMBP49757 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUMBP49757 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUMBP49757 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUMBP49757 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUMBP49757 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUMBP49757 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUMBP49757 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUMBP49757 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUMBP49757 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUMBP49757 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUMBP49757 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NUMBP49757 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUMBP49757 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUMBP49757 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUMBP49757 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUMBP49757 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUMBP49757 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUMBP49757 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUMBP49757 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUMBP49757 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUMBP49757 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUMBP49757 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUMBP49757 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NUMBP49757 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUMBP49757 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUMBP49757 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUMBP49757 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUMBP49757 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUMBP49757 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUMBP49757 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUMBP49757 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUMBP49757 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUMBP49757 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.8 ms