Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-FP30511 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-FP30511 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms